8 мая 2002 года был совершен молебен и освящено место под строительство собора. Строительство велось на средства, выделяемые правительством Мордовии и на пожертвования многочисленных благотворителей. 9 сентября 2004 года состоялась церемония закладки капсулы с мощами в фундамент строящегося храма. К середине 2006 года здание собора было построено.
6 августа 2006 года, в ходе Первосвятительского визита в Саранскую епархию, Святейший Патриарх Московский и всея Руси Алексий II совершил освящение собора во имя святого праведного воина Феодора Ушакова.
Собор стал одним из самых больших храмов России и самым высоким в Поволжье (высота — 63 метра). Он может вместить 3 тысячи молящихся (общая площадь — 900 кв. м.). На четырех звонницах размещены 12 колоколов, самый большой из которых весит 6 тонн.
Одна из главных святынь собора — ковчег с частицами мощей святого праведного воина Феодора Ушакова (1745-1817), адмирала Российского флота, канонизированного в августе 2001 года.